Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nkx6-3Q3UHX8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nkx6-3Q3UHX8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms