Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q3U6N9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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