Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud5Q3U2S4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms