Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms