Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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