Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms