Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms