Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ptchd1Q14B62 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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