Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms