Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms