Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms