Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms