Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RykQ01887 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RykQ01887 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RykQ01887 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms