Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms