Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms