Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms