Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms