Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms