Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Otx1P80205 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Otx1P80205 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Otx1P80205 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms