Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CiitaP79621 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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