Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SeboxP70368 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms