Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms