Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga11P61622 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms