Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap25P60879 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms