Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P58686 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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P58686 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P58686 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P58686 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms