Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms