Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc10P56960 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms