Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms