Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23aP54726 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms