Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfx1P48377 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms