Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pbx1P41778 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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