Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LtbP41155 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LtbP41155 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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