Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtlP38585 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtlP38585 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms