Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxraP28700 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxraP28700 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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