Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CftrP26361 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CftrP26361 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CftrP26361 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms