Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnnc2P20801 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms