Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TP20293 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TP20293 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TP20293 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms