Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms