Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cxcl9P18340 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cxcl9P18340 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cxcl9P18340 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cxcl9P18340 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cxcl9P18340 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl9P18340 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms