Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms