Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaraP11416 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaraP11416 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RaraP11416 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaraP11416 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaraP11416 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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