Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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