Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01734 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01734 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01734 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01734 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01734 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms