Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BlmO88700 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BlmO88700 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BlmO88700 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BlmO88700 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms