Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms