Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smim18J3QNP2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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