Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Taf4bG5E8Z2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Taf4bG5E8Z2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Taf4bG5E8Z2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Taf4bG5E8Z2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms