Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3tc1G3X9F6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms