Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa27F2Z403 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms