Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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